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Post by alamin447 on Aug 4, 2023 23:58:31 GMT -5
分为年轻(人类特有)和老年(非人类特有)。从 Ensembl v92 中检索每个蛋白质编码基因的 dN 和 dS,并将基因分为两组(慢速进化:0.000923 < dN/dS < 0.0993 和快速进化:0.0993 < dN/dS < 29.3),基因相等数字。人类蛋白质-蛋白质相互作用网络是从字符串数据库(rg)下载的。该网 络包括 19,385 个节点和 11,938,498 个边。每个基因 Telegram 用户号码列表的度数是用 R 包 igraph 中的函数“ Degree”计算的 [ 59]。Wilcoxon秩和检验用于比较具有不同特征的基因的事件剪接熵的差异。 直系同源外显子的鉴定 一对一的直系同源蛋白质编码基因是从 Ensembl 版本 92 中获得的。我们使用了两组直系同源基因:所有七个物种的 9371 个直系同源基因(所 鸡作为外群)和五个物种的 13,442 个直系同源基因(人类、黑猩猩、大猩猩、猕猴、小鼠)。对于每个直向同源基因,最长蛋白质编码转录物的外显子用于鉴定直向同源外显子。用于选择性剪接事件的跨物种比较的直系同源外显子是通过根据各自的全链 BLASTZ 文件使用 LiftOver 转换外显子的坐标而获得的,至少有 0.75 匹配(-minMatch 0.75)。在所有考虑的物种中仅使用一对一的
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